Здравствуйте, Павел! Боюсь, что сделать ничего нельзя будет. Если машина прошла регистрацию в ГИБДД, во время которой обязательно проверяют номера двигателя, то получается, что двигатель был заменен Вами. Вам просто не доказать, по прошествию такого количества времени, что в замене двигателя виноват автосалон.